科研与论文创作的软件方案

教育 2021-01-13 810 次浏览 次点赞

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做科研,写论文,已经离不开计算机和应用软件,以下列举一些相应的软件方案(偏生物医学)。采用不同分类标准作小标题,因此个别具体内容会有重复,请根据需求索引。

实验设计软件

Design-Expert是全球顶级的实验设计软件,它适用于各种不同类型的实验设计,可以帮助用户有效减少实验次数,从而更快获取实验结果。使用可对产品或过程进行突破性改进。https://www.statease.com/software/design-expert/

ChemOffice

ChemOffice是一套科学智能的集成式个人生产率工具套件,可帮助化学科学家有效地跟踪其工作,深入了解其数据并专业高效地生成科学报告。http://www.cambridgesoft.com/

通用软件

Microsoft Office核心应用和服务
https://www.office.com/

Microsoft Word: Microsoft Office和现已停产的某些版本的Microsoft Works中包含的文字处理器
Microsoft Excel:一种电子表格编辑器
Microsoft PowerPoint:一种演示程序,用于创建由文本,图形和其他对象组成的幻灯片
Microsoft OneNote:一个记笔记程序,用
Microsoft Outlook(不要与Outlook Express, Outlook.com或Web上的Outlook混淆):一种个人信息管理器,
Microsoft OneDrive:一种文件托管服务
Skype for Business:实时的会议集成通信客户端
Microsoft Teams:一个结合工作场所聊天,会议,笔记和附件的平台。

PowerPoint插件
ScienceSlides,生物医学对象
islide,海量智能模板插件
OneKeyTools,图片制作工具

Adobe CreativeCloud
https://www.adobe.com/creativecloud.html
主要是Adobe图形设计软件
Adobe Photoshop,Adobe Pagemaker,Adobe Lightroom,Adobe InDesign,Adobe InCopy,Adobe ImageReady,Adobe Illustrator,Adobe Freehand,Adobe FrameMaker,Adobe Fireworks,Adobe Acrobat,Adobe XD

Adobe Photoshop,位图编辑软件,用于修改图片
Adobe Acrobat,阅读和编辑PDF文件

两种通用编程语言

R和Rstudio
Python

图表软件

Sigmaplot、Origin、Graphpad是当前科研界最常用的三款科研图表软件,几乎覆盖所有科研专业的图表制作使用。科研图表软件相对于Excel有其独特优势。

Sigmaplot
https://systatsoftware.com/products/sigmaplot/

Origin
https://www.origin.com/

Origin是由OriginLab公司开发的一个科学绘图、数据分析软件。支持各种各样的2D/3D图形。Origin中的数据分析功能包括统计,信号处理,曲线拟合以及峰值分析。Origin强大的数据导入功能,支持多种格式的数据,包括ASCII、Excel、NI TDM、DIADem、NetCDF、SPC等等。图形输出格式多样,例如JPEG,GIF,EPS,TIFF等。内置的查询工具可通过ADO访问数据库数据。现已成为主流科研常用软件之一。

Graphpad
https://www.graphpad.com/

另外,SciDAVis是一款跨平台的免费开源科研绘图软件,开发始于2007年,是QtiPlot的分支,而QtiPlot则是科研绘图软件Origin的克隆。简单来说是免费版的Origin,支持Windows、Mac和Linux全平台的操作系统。基本使用功能和 Origin 相同,而且可以打开 Origin 创建的文件,推荐大家使用。http://scidavis.sourceforge.net/

数据分析

Excel和SPSS是使用和分析数据的可视方式。、
R和Matlab用于编写脚本,因此您可以可靠地多次应用同一分析。它们都以出色的图形输出而著称。
python,是另一个工具。它与R非常相似,因为它是一种具有出色工具和可视化功能的可编写脚本的语言。

如果您想快速简便:Excel
如果您需要快速简便的统计信息:SPSS
如果您想要一个出色的(但价格昂贵的)工程工具:Matlab
如果您想要一个出色的数据分析工具包并希望与他人交流您的结果:R / Rstudio
如果您想要出色的数据分析工具包并与许多计算机科学界人士互动:Python。

数据绘图与统计分析

GraphPad+ Meta分析+ Minitab+ Origin+ R + SAS+ SPSS+ Stata

图像分析

Image J和 Image Pro Plus

专业排版

Indesign

图像制作

二维图:AutoCAD+ Photoshop和illustrator + CorelDRAW
illustrator,矢量编辑软件,用来制作插图排版、绘制示意图

三维图:3Dmax和C4D+ SketchUp+ SolidWorks,MAYA

人工智能识别边缘,背景删除(就是抠图啦)

Topaz Mask
https://topazlabs.com/mask-ai/

PhotoScissors
https://photoscissors.com/

remove.bg
https://www.remove.bg/zh

图像处理

SmartDeblur,图像清晰软件
Image Tuner,图像转换软件
Darktable,数字摄影暗房软件
lightscap,图像渲染软件
Lightroom,数字照片后期处理

更多图像工具

Pichon,图标
https://icons8.com/app

透明PNG素材图
https://www.cleanpng.com/

AI人工智能图片放大
https://bigjpg.com/

截图软件
FastStone Capture
https://www.faststone.org/FSCaptureDetail.htm

文献管理

EndNote 是一个常用的文献/书目管理软件,旨在帮助我们导入,存储和归整参考文献。 它可以自动生成许多不同引用格式的规范引文;它以其优秀的中英文兼容性,方便的格式调整和修改,以及在word文档中的自动导入同步等优势一直广受科研学术工作者的青睐。https://endnote.com/

NoteExpress是一款比较好用的中文文献管理软件。

Zotero是一款功能类似的开源免费软件,既可以单独使用,也可以内嵌于 Firefox 与 Google 浏览器等环境下使用。Zotero的最大优点是能够对在线文献数据库网页中的文献题录直接抓取。https://www.zotero.org/

Mendeley是一款免费的参考文献管理器和学术社交网络,可帮助组织研究、与他人在线合作并了解与时俱进的研究成果。Mendeley的PDF导入与识别能力非常强大,尤其是对期刊全文PDF。只要将PDF文件拖入Mendeley,它能自动识别Titile, Author, Publication, Year… Mendeley。https://www.mendeley.com/

写作

Markdown是一种可以使用普通文本编辑器编写的标记语言,通过简单的标记语法,它可以使普通文本内容具有一定的格式。它的语法简洁明了、学习容易,而且功能比纯文本更强,用于编写说明文档,并以“README.md”的文件名保存在软件的目录下面,除此之外,由于我们有了RStudio这样的神级编辑器,我们还可以快速将Markdown转化为演讲PPT、Word产品文档、LaTex论文甚至是用非常少量的代码完成最小可用原型。

LaTeX(音译“拉泰赫”)是一种基于TEX的排版系统,利用这种格式,即使使用者没有排版和程序设计的知识也可以充分发挥由TeX所提供的强大功能,能在几天,甚至几小时内生成很多具有书籍质量的印刷品。

深度学习框架

TensorFlow和Pytorch

PDF工具

Adobe Acrobat Pro

PDF Shaper是一套功能丰富的PDF软件,可轻松拆分,合并,加水印,签名,优化,转换,加密和解密PDF文档,删除和移动页面,提取文本和图像。https://www.pdfshaper.com/

万兴PDF专家https://pdf.wondershare.cn/

思维导图

XMind
https://www.xmind.net/

MindManager
https://www.mindmanager.com/

流程图

Visio 是Office软件系列中的负责绘制流程图和示意图的软件,是一款便于科研人员、IT和商务人员等就复杂信息、系统和流程进行可视化处理、分析和交流的软件。包括基本流程图、进程图、日程表、业务矩阵、SDL图及其他图形的入门图表。https://www.microsoft.com/en-us/microsoft-365/visio/flowchart-software

NCH ClickCharts Pro是一款超轻便的流程图制作软件。
https://www.nchsoftware.com/chart/index.html

文档翻译

知云文献翻译,打开PDF格式的文档进行阅读翻译。
Xtranslator,支持所有能选中文字的情况比如翻译阅读英文网页、pdf、caj、WORD、软件的chm格式帮助文件等。
http://www.zhiyunwenxian.cn/

chrome浏览器插件

1、解除防止复制的网页插件

simple allow copy chrome插件:

crx格式:chrome内核但非chrome浏览器下载(QQ浏览器、360浏览器、猎豹浏览器等)
https://amy.lanzoux.com/iaI1zhpswkh

zip格式:chrome浏览器下载
https://amy.lanzoux.com/iiBiIhpt7ng

chrome插件安装教程:
https://mp.weixin.qq.com/s/wD4Ikx63uU_kSZbAHXO5yg

2、科研插件

Kopernio(EndNote Click)——学术访问工具,获取论文PDF全文
https://kopernio.com/

Scholarscope——文献筛选辅助,自动加载 PubMed 期刊的影响因子,帮助用户筛选有用的期刊
https://www.scholarscope.cn/

Multi-highlight——高光显示关键词,文献阅读辅助
https://chrome.google.com/webstore/detail/multi-highlight/pfgfgjlejbbpfmcfjhdmikihihddeeji?hl=en-US

Grammarly for Chrome——自动语法检查,论文润色修改辅助
https://www.grammarly.com/

Saladict——沙拉查词,聚合词典划词翻译
https://chrome.google.com/webstore/detail/%E6%B2%99%E6%8B%89%E6%9F%A5%E8%AF%8D-%E8%81%9A%E5%90%88%E8%AF%8D%E5%85%B8%E5%88%92%E8%AF%8D%E7%BF%BB%E8%AF%91/cdonnmffkdaoajfknoeeecmchibpmkmg/related

高速下载

Neat Download Manager
https://www.neatdownloadmanager.com/index.php/en/

IDM,Internet Download Manager
https://www.internetdownloadmanager.com/

文件工具

Advanced Renamer,轻量型批量重命名
https://www.advancedrenamer.com/

Everything,桌面快速搜索
https://www.voidtools.com/
冰点文库下载器,自由下载各类文库并最终生成pdf文件。

FileGee,备份和同步系统
http://en.filegee.com/

Simplenote,云同步纯文本笔记
https://simplenote.com/

公益图书馆

广西壮族自治区图书馆
http://www.gxlib.org.cn/

免费注册,知网、维普、万方文献免费下载。

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